吳建民還曾擔任中國駐荷蘭大使、中國常駐聯合國日內瓦辦事處和瑞士其他國際組織常駐代表、大使，中國駐法國大使。2003年6月27日離任駐法大使時，時任法國總統希拉克破例接受吳建民辭行，并為吳建民頒授“法國榮譽勛位團大騎士勛章”，以此表彰其外交貢獻。

2003年12月，吳建民當選為國際展覽局主席，這是第一位中國人、第一位亞洲人、第一位來自發展中國家的人士擔任這一重要職務。